As principais filmagens começaram em 16 de março de 2020 nos estúdios Babelsberg, perto de Berlim, Alemanha. Em 16 de setembro de 2020, as filmagens foram transferidas para Berlim e as fotos da filmagem foram divulgadas on-line. No início de outubro de 2020, as filmagens aconteceram em Alicante e Valência, Espanha, incluindo a cidade costeira de Javea. Em 23 de outubro de 2020, a Holanda terminou as filmagens de suas cenas, antes que a produção terminasse em 29 de outubro em Barcelona. Em julho de 2021, foram feitas novas filmagens para o filme em Madri.
Igreja Santa Maria del Pi
Em filme
Cena onde Victor, Nathan e Chloe visitam a igreja para procurar o tesouro de Magalhães.
Calendário: 00:00:00
Na realidade
Cena foi filmada na verdadeira Santa Maria del Pi, esta igreja existe e está localizada no centro de Barcelona.
Barcelona
Santa Maria del Pi
Palácio Nacional de Barcelona
Em filme
Cena onde Nathan conhece Chloe, a perseguição começa.
Calendário: 00:00:00
Na realidade
Cena foi filmada no topo da cascata da fonte no Palácio Nacional em Barcelona, é uma dessas fontes em que Drake cai durante a perseguição. O encontro em si acontece em um edifício que está localizado bem na base do palácio. É uma dessas colunas que Drake salta de cima dos telhados de azulejos.
Barcelona
Nacional de Barcelona
Ilha desconhecida nas Filipinas
Em filme
Cena onde Nathan está procurando um lugar secreto onde os tesouros de Magalhães estão escondidos.
Calendário: 00:00:00
Na realidade
Cena foi filmada na Espanha, em Alicante, na Costa Blanca. As coordenadas exatas ainda não foram encontradas.
Barcelona
Estúdios Babelsberg
Em filme
Cena onde Nathan desmaia do avião e tenta subir de volta para as caixas.
Calendário: 00:00:00
Na realidade
Cena foi filmada com o avião foi filmado no estúdio e para isso construíram robôs especiais que controlavam as caixas. Toda a instalação tinha 10 metros de altura e Tom Holland disse em uma entrevista que fazer acrobacias e pular por cima das caixas era bastante assustador.
Potsdam
