As principais filmagens começaram em 16 de março de 2020 nos estúdios Babelsberg, perto de Berlim, Alemanha. Em 16 de setembro de 2020, as filmagens foram transferidas para Berlim e as fotos da filmagem foram divulgadas on-line. No início de outubro de 2020, as filmagens aconteceram em Alicante e Valência, Espanha, incluindo a cidade costeira de Javea. Em 23 de outubro de 2020, a Holanda terminou as filmagens de suas cenas, antes que a produção terminasse em 29 de outubro em Barcelona. Em julho de 2021, foram feitas novas filmagens para o filme em Madri.
Igreja Santa Maria del Pi
Em filme
Cena onde Victor, Nathan e Chloe vão até a igreja para procurar o tesouro de Magalhães. Eles precisam resolver um enigma para ter acesso a uma parte secreta da igreja e chegar mais perto do tesouro.
Calendário: 00:41:40
Na realidade
Cena foi filmada A cena foi filmada na verdadeira Santa Maria del Pi, uma igreja que existe e está localizada no centro de Barcelona. Esse edifício foi escolhido por sua arquitetura gótica do século XIV e sua rica história, pois anteriormente era o local de outra igreja cristã.
Barcelona
Santa Maria del Pi
Ilha desconhecida nas Filipinas
Em filme
Cena onde Nathan está procurando um lugar secreto onde os tesouros de Magalhães estão escondidos.
Calendário: 00:00:00
Na realidade
Cena foi filmada na Espanha, em Alicante, na Costa Blanca. As coordenadas exatas ainda não foram encontradas.
Barcelona
Palácio Nacional de Barcelona
Em filme
Calendário: 00:32:40
Na realidade
Cena foi filmada no topo da cascata da fonte no Palácio Nacional em Barcelona, é uma dessas fontes em que Drake cai durante a perseguição. O encontro em si acontece em um edifício que está localizado bem na base do palácio. É uma dessas colunas que Drake salta de cima dos telhados de azulejos.
Barcelona
Nacional de Barcelona
Avião
Em filme
Cena onde Victor pula do avião com um paraquedas e Nathan, tentando se salvar, joga a carga para fora do avião. Mas a carga, na forma de grandes caixas de madeira, acaba sendo amarrada e presa com segurança no porão. Assim, as caixas simplesmente derrubam Nathan Drake e o jogam para fora do avião. Ele fica preso em uma delas e tem que fazer uma subida muito perigosa para voltar ao avião.
Calendário: 01:14:43
Na realidade
Cena foi filmada com o avião foi filmado no estúdio e para isso construíram robôs especiais que controlavam as caixas. Toda a instalação tinha 10 metros de altura e Tom Holland disse em uma entrevista que fazer acrobacias e pular por cima das caixas era bastante assustador.
Potsdam